El Padrón nominal surge como una necesidad de los establecimientos de salud de contar con una herramienta electrónica que permita contar con un registro de los niños que eran atendidos, ya que cada establecimiento de salud manejaba de manera manual su propio padrón.
En el 2013, en un trabajo en conjunto entre el Ministerio de Salud, el Registro Nacional de Identificación y Estado Civil (RENIEC) y el Ministerio de Economía y Finanzas (MEF) se creó el Padrón Nominal Electrónico, el cual se comenzó a implementar a través de planes de incentivos municipales en municipio de pobreza y pobreza extrema.
Posteriormente se incluyeron los demás municipios, al mejorar el registro y al tener el MINSA registros nominales de atención se decidió en el 2017, utilizar como denominador de múltiples indicadores del niño.
